Genómica Agronómica

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As tecnologias genómicas e moleculares são dos instrumentos mais avançados, que contribuem para melhorar a produtividade e a qualidade dos recursos genéticos vegetais, a sustentabilidade da agricultura e silvicultura e a conservação da biodiversidade vegetal. A atividade de investigação do grupo Genómica Agronómica incide no desenvolvimento de ferramentas de biotecnologia, ao nível da genética molecular e da propagação in vitro de espécies vegetais, como o sobreiro (Quercus suber) e o cardo (Cynara cardunculus), e em novas culturas, como a amendoeira (Prunus dulcis).

Linhas de investigação:

1. Biologia do desenvolvimento Vegetal

Estudos de desenvolvimento vegetal que permitam compreender e aprofundar a base genética da formação e qualidade da cortiça, da produção de compostos bioactivos no cardo, tal como da produção e qualidade da amêndoa.

2. Estratégias de Melhoramento Vegetal Molecular

Com recurso a ferramentas genómicas o desenvolvimento de estratégias que englobam a caracterização da diversidade genética de populações naturais e cultivares, a identificação e seleção de plantas com elevado valor acrescentado com recurso a marcadores moleculares, propagação in vitro de variedades ou genótipos de interesse previamente selecionados.

3. Despiste de doenças em material vegetal

Com o auxílio de técnicas moleculares, a atividade incide no despiste de algumas doenças em material vegetal de propagação, como o caso de viroses de amendoeira.

 

Projetos Mestrado 

Para consultar os projetos de mestrado disponivels clique aqui.

 

Membros do Grupo

 

  Liliana Marum (CV)

  Investigadora principal

  Doutorada em Biologia

  Instituto de Tecnologia Química e Biológica (ITQB)

 

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  Tel: +351 284 314 399
  Ext. 02042

 

 

 

 

  Ana Paulino (CV)

  Estudante de Doutoramento

  Mestrado em Engenharia do Ambiente               

  IPB/ESA

 

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  Tel. + 351 284 314 399

  Ext. 01023/01105

 

                             

 

 

  Ana Luisa Faustino (CV)

  Bolseira de Investigação Científica                        

  Mestrado em Bioquímica

  Universidade de Coimbra                         

 

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  Tel: +351 284319399

  Ext: 01107/01105

  

 


 

  Claúdia Marinho (CV)

  Técnica de laboratório de investigação                   

  Mestre em Biodiversidade e Biotecnologia Vegetal

  Universidade de Coimbra

 

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  Tel: +351 284319399

  Ext: 01107/01105

 

 

Ex-membros

 

Rita Pires, MSc

Sandra Caeiro, BSc

Gonçalo de Almeida, BSc

Sergio João, MSc

Joana Serôdio, MSc

Tiago Capote, PhD

Ana Ferro, PhD

Bárbara Correia, MSc

Sónia Gonçalves, PhD

André Folgado, MSc

Leandra Rodrigues, PhD

Sara Valente, MSc

Tánia Almeida, PhD

 

Projetos em Cursos

 

2023 - SOS_PRODEHESAMONTADO: Modelos de sostenibilidad integral y resiliencia de la dehesa-montado frente a las amenazas climáticas (Refª: 0086_SOS_PRODEHESAMONTADO_4_E)

 

 

Projetos Concluídos

2020 –2023: Inov-Amendo-AL: Inov-Amendo-AL : Microenxertia in vitro de amendoeiras selecionadas para a promoção do amendoal no Alentejo (ALT20-03-0246-FEDER-000068)

2019 – 2023:  MedCyanaraBioTec: Seleção de Genótipos de Cynara cardunculus para Novas Aplicações Biotecnológicas: potenciar a cadeia de valor do cardo, uma cultura mediterrânica bem adaptada (ALT20-03-0145-FEDER- 039495)

2015 - 2019: Lentidev: Uma abordagem molecular da cortiça à porosidade da cortiça” (ALT20-03-0145-FEDER-000020)

2015 - 2018: ValBioTecCynara: “Valorização económica do cardo (Cynara cardunculus): variabilidade natural e suas aplicações biotecnológicas” (ALT20-03-0145- FEDER-000038)

2016 – 2022: SelectPinea: “Desenvolvimento de marcadores genéticos para características de interesse em pinheiro manso (Pinus pinea)” (ALT20-03-0145-FEDER-000041)

2016 - 2020: HydroReuse: “Tratamento e reutilização de águas residuais agroindustriais utilizando um sistema hidropónico inovador com plantas de tomate” (ALT20-03-0145-FEDER-000021)

2012 – 2015: “Genosuber - Sequenciação do genoma do sobreiro” ALENT-07-0224-FEDER-001754

2011 - "Phellogen development & stress response in cork oak” PTDC/AGR-GPL/118856/2010

2009 - “Consórcio de ESTs do Sobreiro - Stress Biótico” SOBREIRO/0014/2009

2009 - “Consórcio de ESTs do Sobreiro - Qualidade da cortiça” SOBREIRO/0038/2009

2009 - “Consórcio de ESTs do Sobreiro - Produção da cortiça” SOBREIRO/0017/2009

2009 - “Transcriptómica da embriógenese do pinheiro bravo” PTDC/AGR-GPL/102877/2008

2009 - “Redes de regulação da expressão génica - actividade do felogénio” PTDC/AGR-GPL/098369/2008

 

Publicações recentes

 

  1. Faustino A., Pires R.C., Marum L. (2023). Periderm differentiation – A cellular and molecular approach to cork oak. Trees – Structure and Function, 37, 627–639 https://doi.org/10.1007/s00468-023-02398-1

  2. Usié, A., Serra, O., Barros, P. M., Barbosa, P., Leão, C. C., Capote, T. C., Almeida, T., Rodrigues, L., Carrasquinho, I., Guimarães, J. B., Mendoça, D., Nóbrega, F., Egas, C., Chaves, I., Abreu, I. A., Saibo, N. J., Marum, L., Varela, M. C., Matos, J., Simões, F., Miguel, C. M., M. Margarida Oliveira, Ricardo, C. P., Gonçalves, S., Ramos, A. M. (2023). An improved reference genome and first organelle genomes of Quercus suber, 19(6). Tree Genetics & Genomes. Springer Science and Business Media LLC. https://doi.org/10.1007/s11295-023-01624-8

  3. Pires RC, Ferro A, Capote T, Usié A, Correia B, Pinto G, Menéndez E, Marum L, 2022. Laser microdissection of woody and suberized plant tissues for RNA-Seq analysis. Molecular biotechnology, 65 (3), 419–432. https://doi.org/10.1007/s12033-022-00542-9

  4. Dias MC, Oliveira JMPF, Marum L, Pereira V, Almeida T, Nunes S, Araújo M, Moutinho-Pereira J, Correia CM, Santos C (2022) Pinus elliottii and P. elliottii x P. caribaea hybrid differently cope with combined drought and heat episodes. Industrial Crops and Products, Volume 176 https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2021.114428

  5. Castro MM, Rosa D, Ferro AM, Faustino A, Paulino A, Brás T, Machado E, Cruz CP, Belo ADF, Nozes P, Portugal J, Ramôa S, Mendonça D, Simões F, Duarte MF, Marum L (2021) Genetic diversity and population structure of Cynara cardunculus L. in southern Portugal. PLoS ONE 16(6): e0252792. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0252792

 

 

 

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